並列化バージョン弱くね? 疑惑
http://wdoor.c.u-tokyo.ac.jp/shogi/tools/view/show-player.cgi?event=LATEST&filter=floodgate&show_self_play=1&user=Gasyou_Atom-D510_1c2t%2Bedd1a7ba7a36303c69262a79f81d0a78
http://wdoor.c.u-tokyo.ac.jp/shogi/tools/view/show-player.cgi?event=LATEST&filter=floodgate&show_self_play=1&user=Gasyou_Atom-D510_2c4t%2Bb29f849aafa476371d3bc54a12b27d43
結論から言うと、デバッグ用にビルドしたバージョンをfloodgateに投入しちゃってました。
そりゃ、遅くて弱いはずですよ。
それから、開発用マシンで走らせてた方で一件バグが出たんで、そっちを修正してから(今度はリリースモードで)floodgateに投入します。